Klingt mir nach einem Timing-Problem. Dabei versucht der Browser, zum Anker zu springen, bevor die Seite vollständig geladen ist. Danach kann sich unter Umständen das Seitenlayout noch verschieben (z.B. größere Bilder werden eingefügt), oder noch schlimmer, der Anker war noch gar nicht vorhanden, und der Sprung wird deshalb ignoriert. Beim zweiten Laden ist dann vieles schon im Cache, und der Effekt tritt dadurch seltener bis gar nicht auf.